De aanleg van Maasvlakte 2 is samen met vier andere waterbouwkundige werken genomineerd voor de prof.dr.ir. J.F. Agemaprijs. Deze prijs wordt eens in de vijf jaar toegekend aan een innovatief Nederlands werk dat in de achterliggende periode is volbracht. De winnaar wordt 10 november bekend gemaakt tijdens de Waterbouwdag 2015 in de Doelen in Rotterdam. Innovatieve waterbouwkundige werken die voor een aanzienlijk deel zijn ontworpen door een Nederlandse ontwerper of gerealiseerd door een Nederlandse aannemer komen in aanmerking voor de Agemaprijs. De prijs, ingesteld door het KIVI, wordt toegekend aan het gehele team van opdrachtgever, ontwerper en aannemer. In het geval van het project Maasvlakte 2 zijn dit opdrachtgever Havenbedrijf Rotterdam en aannemers Boskalis en Van Oord, verenigd in aannemerscombinatie PUMA.

Maasvlakte 2 kan aangemerkt worden als een innovatief waterbouwkundig werk. In onderlinge samenwerking tussen opdrachtgever en opdrachtnemer zijn vele innovatieve oplossingen voor ontwerp, uitvoeringswijzen en surveytechnieken gevonden. Een voorbeeld hierbij is de harde zeewering die is uitgevoerd als keienstrand met voorliggende blokkendam van hergebruikte betonkubussen. Daarnaast is in het project Maasvlakte 2 veel aandacht geweest voor duurzaamheid in ontwerp, inrichting en uitvoering.